上海交大/浙大團隊共同揭示“點燃”胰腺癌免疫微環(huán)境的表觀遺傳治療靶點
近日，上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院薛婧、王宇團隊與上海交大基礎醫(yī)學院唐玉杰，浙江大學王超塵等國內外研究者合作在Gut期刊發(fā)表的最新研究成果，就揭示了經由內源性逆轉錄病毒元件（Endogenous Retroelements，ERs）和表觀遺傳機制，對胰腺癌免疫抑制性微環(huán)境有重要調控作用的靶點MED12，它可能是免疫治療攻破胰腺癌的全新突破口！
研究者們借助CRISPR-Cas9篩選出具有強力免疫抑制效應的MED12后，揭示了MED12的具體作用機制：MED12可穩(wěn)定異染色質蛋白1A（HP1A），使其抑制H3K9me3標記的ERs，而Med12缺失所導致的逆轉錄轉座子去抑制，會激活人體內經典的、由胞質核酸感知通路激活的固有免疫應答，使胰腺癌免疫微環(huán)境變?yōu)槔诿庖咧委煹难装Y型（Inflamed），為免疫治療鋪平道路。
相信各位都知道胰腺癌的腫瘤微環(huán)境有多么讓免疫治療絕望，奇點糕就不用鋪墊了，直接快進到發(fā)現(xiàn)MED12靶點的環(huán)節(jié)吧？從表觀遺傳的角度入手，此前在胰腺癌中還不算多，但借助ERs破局倒真不是什么異想天開，早先就有學者撰文提出，在腫瘤、自身免疫疾病等不同的應用場景中，ERs可能誘導的免疫應答各不相同，有些或許就可利用[1]。
在本次研究中，研究者們進行了專門的CRISPR-Cas9表觀遺傳體外篩選，而在篩選出的多個影響胰腺癌抗腫瘤免疫應答的調控因子中，僅有敲除胰腺癌細胞的Med12，會在小鼠實驗中顯著影響成瘤速度和免疫微環(huán)境；且在免疫健全小鼠身上，敲除Med12會使腫瘤微環(huán)境內浸潤的CD8+T細胞、NK細胞和NKT細胞數(shù)量大增并功能增強，免疫微環(huán)境整體呈炎癥型表現(xiàn)，利好免疫治療。
做到這一步當然還不夠，知其然要知其所以然嘛，于是研究者們開始探索敲除Med12增敏免疫治療的具體機制。基因集富集分析（GSEA）首先提示，敲除Med12后表達上調的基因主要與內源性抗原肽處理和呈遞（由MHC-I類分子進行）有關，同時還有NF-κB和干擾素-α通路相關基因的顯著富集，到這里的發(fā)現(xiàn)還算是意料之中。
但接下來，研究者們在敲除Med12的胰腺癌細胞內意外發(fā)現(xiàn)了大量的內源性雙鏈DNA（dsDNA），同時細胞內感知dsDNA/RNA的關鍵基因表達也顯著上調，意味著NF-κB和干擾素-α通路的激活，是由于dsDNA被胞質核酸感知通路察覺，拉響了外敵入侵的警報；而敲除Mda5、Ddx58兩個胞質核酸感知通路中的關鍵基因，就會使敲除Med12激活的免疫應答消失。
而人體內dsDNA的主要來源，就是奇點糕一開始提到的“伏筆”——ERs，研究者們也通過染色體可及性測序（ATAC-seq）和RT-qPCR證實，敲除Med12激活了ERs，使其中逆轉錄轉座子的染色質可及性增強；同時，敲除Med12也使HP1A蛋白的穩(wěn)定性下降（MED12可直接結合它來增強穩(wěn)定性），削弱了HP1A下游原本專門負責沉默逆轉錄轉座子的H3K9me3調控強度。
此外研究者們還發(fā)現(xiàn)，敲除Med12上調了染色質上大部分轉座子（TEs）部位的H3K27乙酰化修飾水平，這是逆轉錄轉座子進入轉錄激活狀態(tài)的原因，也解釋了前面dsDNA的來源和胞質核酸感知通路激活，啟動固有免疫通路的環(huán)節(jié)；與上述發(fā)現(xiàn)一致，人類胰腺癌患者的MED12蛋白或Med12 mRNA水平，也與免疫治療應答和生存預后直接掛鉤，說明MED12同時具有成為治療靶點和Biomarker的潛力。
-
精英視角
