空間代謝組專題 (二):最全的基質(zhì)選擇指南
前言
通過空間代謝組專題(一):最全的樣本準(zhǔn)備操作指南(點開即可查看),了解了樣本怎么準(zhǔn)備,那么接下來最重要的步驟就是基質(zhì)噴涂了。基質(zhì)是與待測物共結(jié)晶存并吸收激光能量以防止激光直接照射破壞待測物。待測樣品分散在基質(zhì)中,基質(zhì)有效地吸收一定波長的脈沖激光的能量,然后均勻地傳輸?shù)綐悠分校箻悠匪查g蒸發(fā)并離子化。大量的基質(zhì)有效地分散了待測樣品,從而減少了待測樣品分子間的相互作用。
基質(zhì)的選擇是MALDI分析中最重要的步驟之一。理想的基質(zhì)通常具有以下特性:在所使用的激光波長下具有強(qiáng)電子吸收性,較好的真空穩(wěn)定性,較低的蒸氣壓以及與固態(tài)分析物的良好混溶性。
那么該如何選擇什么基質(zhì)呢?基質(zhì)的選擇主要取決于所用激光的波長,其次是待測物的性質(zhì)。通常,高極性分析物在高極性基質(zhì)中更好,非極性分析物最好與非極性基質(zhì)結(jié)合使用。下面我們先通過一篇文章看一下基質(zhì)選擇(太長不想看也可以直接翻到最后有常用基質(zhì)總結(jié))。
?●?發(fā)表期刊:analytical chemistry
?●?影響因子:6.785
?●?發(fā)表時間:2020.04
設(shè)計并合成了一系列新型鄰氨基苯甲酸衍生物(I-IV),其中COOH-NH2(I)和COOH-NHMe(IV)具有酸和堿的雙官能度,用于生物樣品(尤其是脂質(zhì))的基質(zhì)輔助激光解吸/電離-飛行時間質(zhì)譜(MALDI- TOF)成像。在標(biāo)準(zhǔn)的355 nm激光激發(fā)下,系統(tǒng)地研究了I-IV質(zhì)子化,去質(zhì)子化和質(zhì)子轉(zhuǎn)移反應(yīng)的熱量,以及在正離子和負(fù)離子模式下分析生物分子的能力。結(jié)果表明雙極性和酸堿性質(zhì)之間的相關(guān)性。此外,COOH-NHMe(IV)顯示出獨特的性能,并成功地用作MALDI-TOF質(zhì)譜成像(MSI)的基質(zhì),用于研究小鼠的大腦。結(jié)果表明,與商業(yè)基質(zhì)相比,COOH-NHMe(IV)在檢測更多脂質(zhì)和蛋白質(zhì)種類方面具有優(yōu)越性。此外,獲得了脂類分布的MALDI-TOF MSI結(jié)果,使COOH-NHMe(IV)成為了潛在的下一代通用基質(zhì)。
試劑:2,5-DHB;1,5-DAN;芥子酸(SA);CHCA;9-AA;2'',5''-二羥基苯乙酮(2,5-DHAP;2'',6''-二羥基苯乙酮(2,6-DHAP);PC(14:0/14:0),PE(14:0/14:0),PA(14:0/14:0),PS(14:0/14:0)和磷脂酰甘油PG(14:0 / 14:0);萃取溶劑甲醇(MeOH),乙腈(ACN),氯仿和乙酸乙酯(EA)。
樣本:小鼠大腦,12μm切片厚度。
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基質(zhì)合成方法
基質(zhì)合成路線如下圖,市售的COOH-NH2(I)是合成的初始反應(yīng)物,首先用氫化鋁鋰LAH還原COOH-NH2(I),然后與MnO2進(jìn)行氧化反應(yīng),生成醛CHO NH2(II)。然后將CHO-NH2(II)修飾為乙酰胺衍生物CHO-NHAc(III)。同時,COOH-NH2(I)氨基上的一個H被烷基(-CH3)取代以獲得衍生物COOH-NHMe(IV)。本研究采用的反應(yīng)簡易,且以高產(chǎn)率(> 50%)生成目標(biāo)分子。
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基質(zhì)合成路線
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不同基質(zhì)比較
通常,正離子為質(zhì)子化如鈉離子或鉀離子([M + H] +,[M + Na] +和[M + K] +),負(fù)離子為去質(zhì)子化離子([MH]-)。因此,為了量化合成基質(zhì)的可行性,基于密度函數(shù)理論(DFT)進(jìn)行理論計算,以獲取相應(yīng)的質(zhì)子親和力(PA)和去質(zhì)子化能量(DE),其值可以了解分別產(chǎn)生[M + H] +和[MH]-的趨勢。在合成基質(zhì)中,COOH-NHMe(IV)表現(xiàn)出相對較高的PA和較低的DE,因此有望在正負(fù)兩種模式下成為合適的基質(zhì),可與僅適用于正或負(fù)離子模式的商業(yè)基質(zhì)相比較,顯示出其在實際基質(zhì)應(yīng)用中的巨大潛力。
不同基質(zhì)密度函數(shù)理論計算比較
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3
不同基質(zhì)脂質(zhì)和蛋白強(qiáng)度對比
將合成基質(zhì)與一些最具代表性的商業(yè)基質(zhì)進(jìn)行比較,如下圖,每一列為脂質(zhì)或蛋白質(zhì),每一行為一種基質(zhì),紅色表示正離子模式,藍(lán)色表示負(fù)離子模式,顏色越深表示相對信號強(qiáng)度越大。與其他基質(zhì)相比,COOH NHMe(IV)作為基質(zhì)分析的脂質(zhì)顯示出最高的信號強(qiáng)度,且不管是正離子模式或是負(fù)離子模式蛋白質(zhì)豐度也較高。其次是用于脂質(zhì)檢測的1,5-DAN。2,5-DHB和CHCA負(fù)離子豐度較低,通常用于正離子檢測中,9-AA和1,5-DAN適用于負(fù)離子檢測。
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不同基質(zhì)脂質(zhì)和蛋白強(qiáng)度比較
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質(zhì)譜成像評估
為了證明COOH-NHMe(IV)可以檢測脂質(zhì)分布,將其用作小鼠冠狀大腦切片MALDI-TOF MSI的基質(zhì)。在正離子模式下,磷脂酰膽堿PC(36:1)主要分布于大腦白質(zhì),而PC(32:0)主要分布于灰質(zhì)中,與使用其他基質(zhì)的先前報道相符。在負(fù)離子模式下,磷脂酸PA(34:1),磷脂酰乙醇胺PE(36:1),磷脂酰絲氨酸PS(36:0),磷脂酰肌醇PI(38:4)主要分布于灰質(zhì)中,二肉豆蔻酰基磷脂酰乙醇胺DMPE(34:1p)和磷脂酰甘油PG(40:6)主要分布于白質(zhì)中。因此,可以通過MALDI TOF MSI成功地在一個實驗中同時獲得帶有正離子和負(fù)離子的脂質(zhì)的非靶向分子成像。盡管由于設(shè)備的限制,大多數(shù)測試限制在空間分辨率80 μm真空2小時,但該基質(zhì)有可能能夠執(zhí)行高空間分辨率成像,有可能實現(xiàn)5 μm 空間分辨率質(zhì)譜成像。
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質(zhì)譜成像評估結(jié)果
該研究合成了一系列新的鄰氨基苯甲酸衍生物I-IV,其中COOH-NH2(I)和COOH NHMe(IV)具有酸/堿雙官能度,并證明了其在雙極性檢測中的潛力。其中,COOH-NHMe(IV)在激光激發(fā)下,在產(chǎn)生多種生物分子(包括脂質(zhì)和蛋白質(zhì))離子方面表現(xiàn)出卓越效率。使用新合成的基質(zhì),可以輕松獲得小鼠大腦切片中脂質(zhì)的高質(zhì)量分子成像。通過光物理和化學(xué)的更徹底和系統(tǒng)的研究,將很快實現(xiàn)MALDI質(zhì)譜成像的通用基質(zhì)。
參考文獻(xiàn)
Huang P , ?Huang C Y , ?Lin T C , et al. Towards the Rational Design of Universal Dual Polarity Matrix for MALDI Mass Spectrometry. Analytical Chemistry, 2020.
針對不同的樣本類型和關(guān)注目標(biāo),可能適用的基質(zhì)也不同。小分子代謝物和脂質(zhì)最常用的商業(yè)基質(zhì)總結(jié)如下表,在實際項目中會通過預(yù)實驗測試哪種基質(zhì)更合適,選擇對應(yīng)基質(zhì)進(jìn)行正式實驗。
常用基質(zhì)中文英文CAS
CHCA/HCCA
α-氰基-4-羥基肉桂酸
alpha-cyano-4-hydroxycinnamic?acid
28166-41-8
DHB
2,5-二羥基苯甲酸
2,5-dihydroxybenzoic?acid
490-79-9
1,5-DAN
1,5-二氨基萘
1,5-Diaminonaphthalene
2243-62-1
DMCA
3,4-二甲氧基肉桂酸
3,4-Dimethoxycinnamic?acid
?2316-26-9
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