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當前位置: 百趣代謝組學 新聞動態 如何得到真正的高質量數據?

如何得到真正的高質量數據?

2017-08-09

作為代謝組學研究者,我們可能還面臨種種瓶頸,那我們如何發高分的SCI吶?

A.思路創新

B.砸錢

C.交給BIOTREE:專業人才+領先儀器平臺+萬級數據庫+質控到位(全新升級,請往下看)

D.天上掉餡餅

正確答案:C


代謝組學研究中,高通量數據批次內和批次間存在的非生物誤差對分析結果有不可忽視的影響 

首先,樣品的檢測要持續很長時間,尤其是當樣本量很大的時候。在檢測過程中實時地監控儀器穩定性、信號是否正常就十分重要。我們需要及時發現異常,盡早將問題排除,以保證最終采集數據的質量!這就要求我們做好“過程質控”

另外,色譜質譜聯用儀是一個十分復雜精密的系統,隨著時間的推移會受到溫度、濕度、震動、電路板老化等客觀因素的影響,可能會導致一些系統誤差,這是不可避免的。在檢測過程中,由于人的不確定性也會引入一些誤差。這就需要我們對數據進行“漂洗”,將噪音去除掉,做好“數據質控”

BIOTREE提醒:僅對數據做QC質控,即對QC樣本做PCA,只是對最終結果的一個展示。而獲取“最終結果”的過程也要做質量控制


2017年8月8日起,BIOTREE的質控手段全面升級!讓我們來看看全新的質控手段。

一:高質量數據之過程質控

①儀器穩定性

由圖1可以看到,QC樣本TIC出峰保留時間和峰面積都重疊很好,說明儀器穩定性很好。

圖一.jpg

圖1.所有QC樣本TIC疊加圖。

 

②內標響應情況

由圖2可以看到內標XX在樣品中的保留時間和峰面積穩定性很好。說明儀器數據采集穩定性很好。

圖二.jpg 

圖2.內標XX的EIC圖

 

③物質殘留情況

通過對空白樣品的檢測可以考察在檢測過程中物質殘留情況。從圖3中可以看到空白樣品中無顯著峰檢出,說明物質殘留控制的很好。不存在樣品間的交叉污染。

圖三.jpg 

圖3. 空白樣品TIC圖 


二:高質量數據之數據質控

如果“過程質控”是OK的,那么我們要如何來判斷實驗數據是否“可接受”呢?需要以下4條質控來對數據進行把關。

① QC樣本在PCA模式識別中的分布

理論上講,QC樣本都是相同的,但是在物質提取、檢測分析過程中會有系統誤差,導致QC樣品間會有差異。這個差異越小說明整個方法穩定性越好數據質量越高。體現在PCA分析圖上就是QC樣本的分布會聚集在一起。從圖4我們可以看到QC樣本密集分布,說明本次實驗數據質量很高。

1502155901639517.jpg

圖4. PCA得分圖。綠色的點為QC樣本,紅色的點為正式實驗樣本。

② QC樣本的相關性

QC樣本相關性越高(越接近于1)說明整個方法穩定性越好數據質量越高。從圖5我們可以看到QC樣本相關性很高,說明本次實驗數據質量很高。

圖5.jpg 

圖5. QC樣本相關性分析

③ QC樣本中內標響應的穩定性

QC樣本中內標為外源引入的物質,加入的量也是相同的。所以內標的響應差異越小(RSD30%),說明系統越穩定,數據質量越高。

1502155983413585.jpg 

表1. QC樣本中內標檢測情況

④ QC樣本中信號響應穩定的峰的占比

QC樣本中信號響應穩定的峰才是真正有意義的數據,那么這些穩定峰的占比可以用來衡量數據的質量。占比越高,說明數據的質量越高。從表2中數據可以看到本次實驗數據按照RSD≤30%篩選后的得率,無論是負離子模式還是正離子模式都需要高于70%,則說明實驗數據質量很高。.

微信圖片_20170808133240.jpg

表2. QC樣本RSD30%篩選得率

BIOTREE會根據實驗的情況來選擇具體的質控手段。


結論:

我們不能100%滿足您對數據的生物學要求,但是我們一定給您提供真實可靠、質量過關的數據,以供您進行科學研究,發表高質量的論文。


2017年8月8日起,BIOTREE的LCMS數據庫也升級啦!

BIOTREE MSMS Database 已突破10000物質二級質譜信息,

也就是說BIOTREE擁有10000+物質二級譜圖,并且其中有2500+物質是用標品打出來的,而且在年底之前有望突破5000~~HOHO~~

 

2017年8月8日起,BIOTREE所有的分析報告也將升級!!

① 增加所有檢測物質分類信息、索引信息

② 增加數據預處理前后對比

微信圖片_20170808135252.jpg

沉迷科研,日漸消瘦!為了質量,BIOTREE小伙伴們也是廢寢忘食,使出了洪荒之力。為不斷改進技術方法,為代謝組學技術更新輸送源動力,更為給我們親愛的小主們持續帶來高質量的數據,我們很遺憾的通知各位小主,我們的LC-MS產品線價格將上漲20%!你沒看錯,不是降價,是價格上漲,我們的口號是拒絕低價低品質!

漲價生效日期2017年8月8日,詳請請咨詢400-664-9912。

 

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