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如何得到真正的高質(zhì)量數(shù)據(jù)?

2017-08-09

作為代謝組學(xué)研究者,我們可能還面臨種種瓶頸,那我們?nèi)绾伟l(fā)高分的SCI吶?

A.思路創(chuàng)新

B.砸錢

C.交給BIOTREE:專業(yè)人才+領(lǐng)先儀器平臺+萬級數(shù)據(jù)庫+質(zhì)控到位(全新升級,請往下看)

D.天上掉餡餅

正確答案:C


代謝組學(xué)研究中,高通量數(shù)據(jù)批次內(nèi)和批次間存在的非生物誤差對分析結(jié)果有不可忽視的影響 

首先,樣品的檢測要持續(xù)很長時間,尤其是當(dāng)樣本量很大的時候。在檢測過程中實時地監(jiān)控儀器穩(wěn)定性、信號是否正常就十分重要。我們需要及時發(fā)現(xiàn)異常,盡早將問題排除,以保證最終采集數(shù)據(jù)的質(zhì)量!這就要求我們做好“過程質(zhì)控”

另外,色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀是一個十分復(fù)雜精密的系統(tǒng),隨著時間的推移會受到溫度、濕度、震動、電路板老化等客觀因素的影響,可能會導(dǎo)致一些系統(tǒng)誤差,這是不可避免的。在檢測過程中,由于人的不確定性也會引入一些誤差。這就需要我們對數(shù)據(jù)進(jìn)行“漂洗”,將噪音去除掉,做好“數(shù)據(jù)質(zhì)控”

BIOTREE提醒:僅對數(shù)據(jù)做QC質(zhì)控,即對QC樣本做PCA,只是對最終結(jié)果的一個展示。而獲取“最終結(jié)果”的過程也要做質(zhì)量控制


2017年8月8日起,BIOTREE的質(zhì)控手段全面升級!讓我們來看看全新的質(zhì)控手段。

一:高質(zhì)量數(shù)據(jù)之過程質(zhì)控

①儀器穩(wěn)定性

由圖1可以看到,QC樣本TIC出峰保留時間和峰面積都重疊很好,說明儀器穩(wěn)定性很好。

圖一.jpg

圖1.所有QC樣本TIC疊加圖。

 

②內(nèi)標(biāo)響應(yīng)情況

由圖2可以看到內(nèi)標(biāo)XX在樣品中的保留時間和峰面積穩(wěn)定性很好。說明儀器數(shù)據(jù)采集穩(wěn)定性很好。

圖二.jpg 

圖2.內(nèi)標(biāo)XX的EIC圖

 

③物質(zhì)殘留情況

通過對空白樣品的檢測可以考察在檢測過程中物質(zhì)殘留情況。從圖3中可以看到空白樣品中無顯著峰檢出,說明物質(zhì)殘留控制的很好。不存在樣品間的交叉污染。

圖三.jpg 

圖3. 空白樣品TIC圖 


二:高質(zhì)量數(shù)據(jù)之數(shù)據(jù)質(zhì)控

如果“過程質(zhì)控”是OK的,那么我們要如何來判斷實驗數(shù)據(jù)是否“可接受”呢?需要以下4條質(zhì)控來對數(shù)據(jù)進(jìn)行把關(guān)。

① QC樣本在PCA模式識別中的分布

理論上講,QC樣本都是相同的,但是在物質(zhì)提取、檢測分析過程中會有系統(tǒng)誤差,導(dǎo)致QC樣品間會有差異。這個差異越小說明整個方法穩(wěn)定性越好數(shù)據(jù)質(zhì)量越高。體現(xiàn)在PCA分析圖上就是QC樣本的分布會聚集在一起。從圖4我們可以看到QC樣本密集分布,說明本次實驗數(shù)據(jù)質(zhì)量很高。

1502155901639517.jpg

圖4. PCA得分圖。綠色的點為QC樣本,紅色的點為正式實驗樣本。

② QC樣本的相關(guān)性

QC樣本相關(guān)性越高(越接近于1)說明整個方法穩(wěn)定性越好數(shù)據(jù)質(zhì)量越高。從圖5我們可以看到QC樣本相關(guān)性很高,說明本次實驗數(shù)據(jù)質(zhì)量很高。

圖5.jpg 

圖5. QC樣本相關(guān)性分析

③ QC樣本中內(nèi)標(biāo)響應(yīng)的穩(wěn)定性

QC樣本中內(nèi)標(biāo)為外源引入的物質(zhì),加入的量也是相同的。所以內(nèi)標(biāo)的響應(yīng)差異越小(RSD30%),說明系統(tǒng)越穩(wěn)定,數(shù)據(jù)質(zhì)量越高。

1502155983413585.jpg 

表1. QC樣本中內(nèi)標(biāo)檢測情況

④ QC樣本中信號響應(yīng)穩(wěn)定的峰的占比

QC樣本中信號響應(yīng)穩(wěn)定的峰才是真正有意義的數(shù)據(jù),那么這些穩(wěn)定峰的占比可以用來衡量數(shù)據(jù)的質(zhì)量。占比越高,說明數(shù)據(jù)的質(zhì)量越高。從表2中數(shù)據(jù)可以看到本次實驗數(shù)據(jù)按照RSD≤30%篩選后的得率,無論是負(fù)離子模式還是正離子模式都需要高于70%,則說明實驗數(shù)據(jù)質(zhì)量很高。.

微信圖片_20170808133240.jpg

表2. QC樣本RSD30%篩選得率

BIOTREE會根據(jù)實驗的情況來選擇具體的質(zhì)控手段。


結(jié)論:

我們不能100%滿足您對數(shù)據(jù)的生物學(xué)要求,但是我們一定給您提供真實可靠、質(zhì)量過關(guān)的數(shù)據(jù),以供您進(jìn)行科學(xué)研究,發(fā)表高質(zhì)量的論文。


2017年8月8日起,BIOTREE的LCMS數(shù)據(jù)庫也升級啦!

BIOTREE MSMS Database 已突破10000物質(zhì)二級質(zhì)譜信息,

也就是說BIOTREE擁有10000+物質(zhì)二級譜圖,并且其中有2500+物質(zhì)是用標(biāo)品打出來的,而且在年底之前有望突破5000~~HOHO~~

 

2017年8月8日起,BIOTREE所有的分析報告也將升級!!

① 增加所有檢測物質(zhì)分類信息、索引信息

② 增加數(shù)據(jù)預(yù)處理前后對比

微信圖片_20170808135252.jpg

沉迷科研,日漸消瘦!為了質(zhì)量,BIOTREE小伙伴們也是廢寢忘食,使出了洪荒之力。為不斷改進(jìn)技術(shù)方法,為代謝組學(xué)技術(shù)更新輸送源動力,更為給我們親愛的小主們持續(xù)帶來高質(zhì)量的數(shù)據(jù),我們很遺憾的通知各位小主,我們的LC-MS產(chǎn)品線價格將上漲20%!你沒看錯,不是降價,是價格上漲,我們的口號是拒絕低價低品質(zhì)!

漲價生效日期2017年8月8日,詳請請咨詢400-664-9912。

 

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