利用自然群體、人工群體作為研究材料，基于重測序的信息，結合代謝組結果，進行代謝組的全基因組關聯分析（metabolome Genome-Wide Association Study, mGWAS），批量、精準定位候選基因，挖掘代謝生理、表型相關的功能基因，闡釋相關pathway分子、生化機理。mGWAS利用代謝物作為數量性狀與基因組變異位點進行關聯分析，在分析過程中，通常檢測到的代謝物數量多（＞400種代謝物）、差異大（10-10000倍）、遺傳效應高（解釋超過40%變異），得到的結果因此優于傳統表型性狀GWAS。

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